Программа будет не видима в списке задач Windows 9x, если ее зарегистрировать как сервис. А теперь на примере:

    1. Создайте новый проект.
    2. Создаете модуль и добавьте в него

        Public Declare Function RegisterServiceProcess Lib "kernel32.dll" (ByVal dwProcessId As Long, ByVal dwType As Long) As Long
        Public Declare Function GetCurrentProcessId Lib "kernel32.dll" () As Long

    3. Далее вставляем в код формы:

        Private Sub Form_Load()
            Call RegisterServiceProcess(GetCurrentProcessId, 1)
        End Sub

    4. Далее сохраняем, запускаем, нажимаем ctrl+alt+del и смотрим.
Для непонятливых смотрите более подробный пример: Trick_5(Скачать)